读书笔记的整理，主要有两种方法，一种是为笔记本中的资料编制分类目录，另一种是为笔记本的资料编制关键词索引。至于用活页簿来积累资料，性质近乎卡片，便于分类保存。
(1)编制分类目录。如果一个厚本子记满了各种资料，为了日后查找的方便，可以为本子中的所有资料编一个分类目录，注明页码，贴在本子的前面。如果事先在本子的前面留下空白页，用来誊录分类目录，那当然更理想。
(2) 编制关键词索引。所谓关键词，就是从文献的标题或正文中选取的，对于揭示文献内容具有实质意义，并且有检索意义的词语。人名、书刊名、篇名、地名、机构名、事件名、概念术语等，都可以作为关键词。把这些关键词按汉语拼音音序排列，注明出处，便是关键词索引。
(3)利用计算机数据库收集整理资料。在收集的资料比较多，尤其是利用文献数据库获得的数据比较多时，可以利用Excel表格或者通过自建数据库的方法记录和整理文献资料。字段内容至少应包括篇名、作者、文献来源、主题词、提要、分类号等。如果是图片或全文电子文党，则要设置多个文件夹，按主题分类存放。类似卡片分类一样，文件夹中又可以细分为多个文件夹。
